计算机应用 ›› 2014, Vol. 34 ›› Issue (12): 3433-3437.
收稿日期:
2014-06-23
修回日期:
2014-08-11
出版日期:
2014-12-01
发布日期:
2014-12-31
通讯作者:
孟军
作者简介:
基金资助:
辽宁省自然科学基金资助项目
Received:
2014-06-23
Revised:
2014-08-11
Online:
2014-12-01
Published:
2014-12-31
Contact:
MENG Jun
Supported by:
Natural Science Foundation of Liaoning Province of China
摘要:
针对多源异构蛋白质相互作用网络信息量大、数据冗余导致预测结果不能充分反映数据分布信息的问题,将功能类别网络和蛋白质相互作用网络相结合,提出基于有向双关系图和多核融合的多标记学习算法。首先,构建基于含有损失函数的目标方程和最大期望算法的自适应模型;然后,利用图优化策略融合功能类别和蛋白质相互作用网络构成的多个关联矩阵;最后,将融合后的关联矩阵代入模型中预测蛋白质功能。在Yeast和Mouse的蛋白质多源异构数据上的实验结果表明,提出的方法具有预测准确率高、标签损失率低等优势。
中图分类号:
孟军 刁印. 基于有向双关系图和多核融合的蛋白质功能预测[J]. 计算机应用, 2014, 34(12): 3433-3437.
MENG Jun DIAO Yin. Protein function prediction based on directed bi-relational graph and multi-kernel fusion[J]. Journal of Computer Applications, 2014, 34(12): 3433-3437.
[1]LANCKRIET G R G, CRISTIANINI N,JORDAN M I, et al. Kernel-based integration of genomic data using semidefinite programming [M]. Cambridge: MIT Press, 2003: 231-235. |
[1] | 陈露 张晓霞 于洪. 基于先验知识的非负矩阵半可解释三因子分解算法[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[2] | 李晓杰 崔超然 宋广乐 苏雅茜 吴天泽 张春云. 基于时序超图卷积神经网络的股票趋势预测方法[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[3] | 李宗正 周恺卿 丁雷 欧云. 基于基因交换的自适应人工鱼群算法[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[4] | 刘清华 廖士中. 基于随机素描方法的在线核回归[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[5] | 刘忠慧 王梓宥 闵帆. 近似概念的遗传生成算法及其推荐应用[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[6] | 汪敏 冯婷婷 闵帆 唐洪明 闫建平 廖纪佳. 页岩气储层预测的多标签主动学习算法[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[7] | 任柯舟, 彭甫镕, 郭鑫, 王喆, 张晓静. 动态融合社交信息的社会化推荐[J]. 计算机应用, 2021, 41(10): 2806-2812. |
[8] | 张志浩, 林耀进, 卢舜, 郭晨, 王晨曦. 缺失标记下基于类属属性的多标记特征选择[J]. 计算机应用, 2021, 41(10): 2849-2857. |
[9] | 王雅辉, 钱宇华, 刘郭庆. 基于模糊优势互补互信息的有序决策树算法[J]. 计算机应用, 2021, 41(10): 2785-2792. |
[10] | 顾军华 樊帅 李宁宁 张素琪. 基于知识图偏好注意力网络的长短期推荐模型及其更新方法[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[11] | 王海起 王志海 李留珂 孔浩然 王琼 徐建波. 基于网格划分的城市短时交通流量时空预测模型[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[12] | 陈恒 王思懿 李正光 李冠宇 刘鑫. 基于关系记忆的胶囊网络知识图谱嵌入模型[J]. 计算机应用, 0, (): 0-0. |
[13] | 张成, 万源, 强浩鹏. 基于知识蒸馏的深度无监督离散跨模态哈希[J]. 计算机应用, 2021, 41(9): 2523-2531. |
[14] | 孙浩艺, 王传美, 丁义明. 基于隐藏层输出矩阵的极限学习机算法优化[J]. 计算机应用, 2021, 41(9): 2481-2488. |
[15] | 卞凌志, 王直杰. 基于增强多维多粒度级联森林的信用评分模型[J]. 计算机应用, 2021, 41(9): 2539-2544. |
阅读次数 | ||||||
全文 |
|
|||||
摘要 |
|
|||||