检索结果

Select

1. 蛋白质相互作用网络演化模型研究进展

骆嘉伟梁成宋丹李光辉

计算机应用 2013, 33 (03): 816-820. DOI: 10.3724/SP.J.1087.2013.00816

摘要（744）

PDF （900KB）（472）

研究蛋白质相互作用网络的演化机制及模型对于理解生物系统的进化及组织形成过程具有重要的意义。到目前为止,已经出现了多种依赖不同演化机制的蛋白质相互作用网络演化模型,这些模型有针对性地体现了真实蛋白质相互作用网络中出现的某些拓扑特征,但同时也具有一定的局限性。通过对典型蛋白质相互作用网络演化模型进行研究,从模型的构建机理、演化模型及真实蛋白质相互作用网络的拓扑特征等方面进行了分析和比较,并总结了各个模型的特点。最后,对蛋白质网络演化模型的进一步发展提出了自己的看法,为深入理解蛋白质相互作用网络演化模型提供有益参考。

参考文献 | 相关文章 | 多维度评价

Select

2. 区域卫生信息化中单点登录系统的设计与实现

骆嘉伟唐国英

计算机应用 2012, 32 (06): 1782-1786. DOI: 10.3724/SP.J.1087.2012.01782

摘要（1218）

PDF （756KB）（812）

针对区域卫生信息化平台中的多个应用系统的统一认证授权和单一登录，以及基于角色的访问控制模型不能直接应用到单点登录中等问题，提出了一种基于角色组的角色控制策略和JASIG-CAS相结合的统一身份认证系统。中央认证服务(CAS)服务端引用MyBatis技术有效展示了子系统信息，各个应用系统之间采用Axis2来实现用户信息同步，并利用Session存储用户在各个系统中的权限来减少对数据库的频繁访问，从而显著改善了平台的性能。该单点登录系统实现了统一用户管理、统一权限分配、统一平台风格样式等功能。最后，采用专业压力测试工具LoadRunner8.0对平台进行了性能测试和分析，测试结果表明该系统总体性能稳定，平台设计合理。

相关文章 | 多维度评价

Select

3. 基于YKW图形表达的人类基因短编码序列识别

骆嘉伟颜军何海峰

计算机应用 2011, 31 (08): 2087-2091. DOI: 10.3724/SP.J.1087.2011.02087

摘要（1134）

PDF （716KB）（805）

针对人类短编码序列的识别问题，根据碱基在密码子三个位置的偏性和碱基自身物理化学性质的分类，提出一种新的图形表示方法——YKW图形，然后在此图形上，提取了9个有效的面积矩阵特征，识别过程中，为了提高识别率利用递增特征选择算法添加4个统计特征，并采用主元分析(PCA)方法对这13个特征降维，最后使用支持向量机(SVM)对人类的短编码序列进行编码区/非编码区识别。实验结果表明，与其他方法相比，该方法使用较少的特征(7个或4个)取得了更好的识别结果。

参考文献 | 相关文章 | 多维度评价

Select

4. 基于茎区组合的RNA二级结构预测算法

骆嘉伟陈涛

计算机应用 2010, 30 (06): 1694-1697.

摘要（868）

PDF （587KB）（937）

RNA二级结构预测是生物信息学的研究热点和难点,特别是对于含假结的RNA二级结构的预测,已经被证明是NP问题。根据RNA折叠的特点,提出了一种基于茎区组合的智能优化算法来预测RNA 的二级结构。该算法以RNA的茎区为基本单元,结合图论思想,通过二元关系的基本理论,依据自由能最小原则获取茎区的最优组合。该算法的时间复杂度为O(n3),空间复杂度为O(n2),而且可以发现假结。实验结果证明了算法的有效性。

相关文章 | 多维度评价

Select

5. 基于信息离散度的DNA序列相似性分析

骆嘉伟刘芳杨华

计算机应用

摘要（1206）

PDF （558KB）（945）

信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用，其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异，但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法，利用不同距离的碱基对的联合概率分布差异来表示DNA序列之间的差异，并分析了信息集变化对结果的影响。实验结果表明，该方法是分析DNA序列相似性的简单且有效的工具。当信息集变化时，相似度较高的序列间的距离值变化很小。

相关文章 | 多维度评价

Select

6. 基于快速动态权重匹配的RNA二级结构预测算法

骆嘉伟彭政

计算机应用

摘要（1490）

PDF （609KB）（1041）

在动态权重匹配算法的基础上提出了基于快速动态权重匹配的RNA二级结构预测算法。通过引入最大动态权重茎区搜索算法降低时间复杂度和扩大搜索假结的区域提高预测假结的能力，使得快速动态权重匹配算法与动态权重匹配算法相比，不仅具有O(n3)的更加理想的时间复杂度，而且还能预测更多可能存在的假结。

相关文章 | 多维度评价

Select

7. 基因序列图形表达及聚类分析应用研究

周迎春骆嘉伟杨莉

计算机应用

摘要（1134）

PDF （694KB）（1200）

在基因序列图形表达模型研究的基础上，提出了一种新的非退化的基因图形三维表示方法。该表达方法不仅避免了图形的重叠和交叉，同时还保留了序列的生物学特征。利用该表达方法对H5N1病毒基因序列进行数字特征的提取并引入基于多维PFS判别函数进行模糊聚类分析应用。在聚类分析过程中直接利用数字特征矩阵作为分析数据，分析结果表明：利用文中所给图形表达建立基因序列数字特征矩阵进行的聚类分析具有一定的合理性。

相关文章 | 多维度评价

Select

8. 一种结合完全连接的改进Apriori算法

骆嘉伟;王艳;杨涛;吴君浩

计算机应用

摘要（2208）

PDF （802KB）（991）

基于Apriori算法原理，提出一种有效的完全连接条件，在频繁2k-项集的集合L2k进行自身Apriori连接得频繁(2k+1)-项集的同时，自身完全连接产生未剪枝的候选4k-项集；对频繁(2k+1)-项集的集合L2k+1，直接对其项集进行完全连接产生未剪枝的候选(4k+2)-项集。改进的算法减少了连接的比较次数、迭代运算次数。实验表明该算法在保证无遗漏的情况下有效地提高了Apriori算法的挖掘速度。

相关文章 | 多维度评价

Select

9. 基于马氏距离的缺失值填充算法

杨涛;骆嘉伟;王艳;吴君浩

计算机应用 2005, 25 (12): 2868-2871.

摘要（1869）

PDF （763KB）（1690）

提出了一种基于马氏距离的填充算法来估计基因表达数据集中的缺失数据。该算法通过基因之间的马氏距离来选择最近邻居基因，并将已得到的估计值应用到后续的估计过程中，然后采用信息论中熵值的概念计算最近邻居的加权系数，得到缺失数据的填充值。实验结果证明了该算法具有有效性，其性能优于其他基于最近邻居法的缺失值处理算法。

相关文章 | 多维度评价