�·��Ӷ���ѧ��ݾ��෨�ڻ���������ϵ�Ӧ��
���,����
���ӿƼ���ѧ ������ѧ�빤��ѧԺ,�ɶ� 610054
Applications of molecular-kinetic-theory-based clustering approach on gene expression data
LI Jun-lin, FU Hong-guang
School of Computer Science and Engineering, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu Sichuan 610054, China
ժҪ Ϊ��ʶ������ܾ������������������,����ʹ�þ���ķ����Ի�������ݽ��з���,��·��Ӷ���ѧ���෨ͨ���Ч���Ӽ�������������ܴﵽ����ݾ����Ŀ�ġ��·��Ӷ���ѧ���༼������ҪԤ��ظ���,�ҿ����ڹ�������еĴظ���÷�����Ӧ���ڻ��������,������ָ�����Թ�������д��ڵĴظ���ͷ��ֿ��ܾ������������������ʵ������������ʾ�˷·��Ӷ���ѧ���༼���������õ�֪ʶ�ھ�������
�ؼ�� ��
���� ,
���Ӷ���ѧ ,
�������� ,
������ ,
����ھ� ,
֪ʶ����
Abstract ��In order to find possible diagnostic genes that may typically assist in disease diagnosis, clustering technologies are always used to analyze gene expression data. Molecular-kinetic-theory-based clustering approach is a new and effective clustering technique. It finds data clusters by following the molecular kinetic mechanism. This dynamic clustering approach does not require presetting the number of clusters and can be used to estimate the number of clusters. The authors applied the method on gene expression data to estimate the number of clusters and possible diagnostic genes according to relevant clustering criteria. The simulation results and analysis verify the good knowledge discovery ability of this approach.
Key words ��
clustering
molecular kinetics
interaction
gene expression
data mining
knowledge discovery
�ո�����: 2011-03-10
��������: 2011-10-11
�������: �����Ȼ��ѧ���������Ŀ(61073099);�����У�����ҵ���ר���ʽ�������Ŀ(103.1.2 E022050205;ZYGX2009J058)
ͨѶ����:
���
E-mail: myronsaga1@sohu.com
����� : ���(1980-),��,�Ĵ��ϳ���,��ʿ,��Ҫ�о�����:�˹����ܡ�����ѧϰ������ھ�;����(1965-),��,�Ĵ��ɶ���,����,��ʿ��ʦ,��Ҫ�о�����:���������Զ����?֪ʶ���̡�
[1]
����ƽ ֣�� ÷���. ���ڸĽ��˹���Ⱥ�㷨��K��ֵ�����㷨 [J]. , 2014, 34(4): 1065-1069.
[2]
����. ���ڼ�Ȩ�����ռ���Ϣ�Ӿ��ʵ��ͼ�����ģ�� [J]. , 2014, 34(4): 1172-1176.
[3]
���h ����Ӣ ������. ���������ģ�����ں��������Ŵ����ϵͳ�е�Ӧ�� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(3): 763-766.
[4]
�� ������ �ޱ� ����. �����״Լ���Graph Cut���˷ָ� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(3): 837-840.
[5]
����ΰ. �����罻�����»������ζȵ���Ϣ����ģ�� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(2): 411-416.
[6]
��ژ�� ��ѧǿ ��. ����ͻ���ʾ������ͻ���¼���ⷽ�� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(2): 486-490.
[7]
����Զ ��� ����. ����CCSDSЭ���δ֪Э������ [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 23-26.
[8]
������ ������ ���DZ�. ����K-means�ĸĽ��˹���Ⱥ�����㷨 [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 204-207.
[9]
������ �ž���. ����LDA�ĸĽ�K-means�㷨���ı������е�Ӧ�� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 249-254.
[10]
ʢ�鲨 ������. ���ھֲ����������Ӧ���Խ��ڴ��ݷ����㷨 [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 255-259.
[11]
������ ������. FCMԤѡȡ��İ�ලSVMͼ������ [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 260-264.
[12]
������ ·�� ���� Ԭ��ʤ ����. OPTICS�㷨�����ٽ�Ԥ���е�Ӧ�� [J]. �����Ӧ��, 2014, 34(1): 297-301.
[13]
���� ��� �ֶ���. �Ƽ��㻷���»��ڴ�����������ܶȾ�������¼���⼰���� [J]. �����Ӧ��, 2013, 33(12): 3559-3562.
[14]
���� �����. �����˹�����ϵͳ�ĵ������������������㷨 [J]. �����Ӧ��, 2013, 33(12): 3567-3570.
[15]
���� ���. �ռ�������������ά�� [J]. �����Ӧ��, 2013, 33(11): 3049-3051.